Vírus podem danificar hardware?

Sim, é um possível que um vírus danifique o hardware do computador.

Para que um código malicioso danifique hardware, ele precisa se aproveitar de um problema do próprio hardware. Foi o caso do vírus Chernobyl (1998), que "matava" as placas-mãe porque elas não protegiam o programa de inicialização (BIOS) e também não tinham capacidade de recuperação do mesmo, sendo obrigatória a substituição do chip ou da placa inteira.

O Chernobyl não é mais capaz de funcionar nos PCs de hoje e não se tem conhecimento de outro vírus que danifique o hardware, embora isso seja tecnicamente possível. Seus problemas são provavelmente causados por software.

Vale mencionar que um programa não precisa ser malicioso para causar danos aos componentes físicos do computador. A distribuição Linux Ubuntu, muito popular entre iniciantes no sistema, tinha um comportamento de economia de energia que, em alguns notebooks, reduzia o tempo de vida útil do disco rígido; em certos casos, até mesmo um "click" podia ser ouvido. Os desenvolvedores do Ubuntu contornaram o problema, mas, vale deixar bem claro, isso só aconteceu porque os discos apresentam um erro.

Hardwares também têm defeitos na programação de seus componentes -- "bugs" não são exclusivos de softwares

Vírus resistem à reformatação do disco?

A reformatação e o reparticionamento do disco eliminam qualquer tipo de vírus ali armazenado. Teoricamente seria possível, sim, um vírus se armazenar na BIOS. Mas isso está restrito a ataques específicos e seria difícil que esse fosse seu caso.

Geralmente quando um vírus volta para o computador depois de uma reformatação, o que acontece é que o disquete, o CD-ROM ou outras ferramentas usadas para realizar a tarefa estavam infectadas. Por isso, o disco foi reinfectado durante o próprio processo de reformatação. Em outros casos, cópias piratas infectadas do Windows foram usadas para a instalação do sistema.